TB后续剧情大纲
1、为了取得波西米亚（Bohemia）公国的资源，获取更大的利益，教皇厅和格马尼库斯（Germanicus）王国打算入侵波西米亚。身为阿尔比恩（Albion）女王的艾丝缇，为了阻止这项阴谋而介入其中。她提议在布拉格（Prague）召开由当事国参加的国际会议，并决定亲自参加。为了阻止艾丝缇的行动，教皇厅和格马尼库斯派出了众多刺客企图暗杀她。在教皇厅的极端分子所积极策划这场阴谋背后，蔷薇十字骑士团和该隐也涉足其中。
2、另一方面，亚伯和以恩正在追踪一批从维特（Vitter）岛被盗走的神秘资料，两人朝波西米亚公国进发。为了寻找线索，他们假扮成布拉格某所大学的老师（亚伯）和学生（以恩），展开了调查。
3、亚伯察觉到暗杀（艾丝缇的）阴谋以及该隐的策略，于是打算帮助艾丝缇从布拉格脱出。但是卡特琳娜认为，这是向全世界揭露蔷薇十字骑士团的存在的绝好机会，因而没有听从亚伯的请求。此时的卡特琳娜已身患胶原病而时日不多，对她而言，这是消灭骑士团的最后的机会。同时，她对亚伯的感情也愈加难以抑制，再加上因亚伯对艾丝缇的关注而产生的嫉妒心，使得她失去了冷静地判断当前局势的能力。
4、最终，亚伯再次离开了AX，决定和以恩一起营救艾丝缇。卡特琳娜被他的行动所激怒，她派遣托雷士和莫尼卡潜入波西米亚首都布拉格，命令他们逮捕亚伯。
5、教皇亚历山卓、日耳曼国王路德威格、阿尔比恩女王艾丝缇以及波西米亚的里普希夫人(?)正在进行紧张的谈判。与此同时，亚伯决心对抗由弗兰契斯柯的异端审问局所派出的刺客朱迪丝修女和骑士团所派出的艾丝缇暗杀团。但是，他遭到了受命于卡特琳娜而前来逮捕他的托雷士和莫尼卡的阻挠，亚伯阻止暗杀行动的计划失败了。当艾丝缇陷入危机就快被朱迪丝修女杀死时，教皇亚历山卓冲上前挡下了这致命一击。艾丝缇虽然九死一生，但亚历山卓为了保护她而献出了生命。
6、该隐现身并与亚伯交手，亚伯再次被该隐击败。波西米亚公国因格马尼库斯和教皇厅军队的进攻而灭亡。艾丝缇勉强逃脱，回到了阿尔比恩。
7、得知亚历山卓的死讯，卡特琳娜陷入深深的悲痛和自责中，她的健康状况愈加恶化。此次事件之后，她几乎不在公众场合出现。弗兰契斯柯同样为亚历山卓之死而悲伤，但他很快就宣称自己登上教皇之位，并将为世界以及教皇厅贡献自己的力量。
8、新教皇弗兰契斯柯声称，阿尔比恩女王艾丝缇应对前教皇亚历山卓之死负责。并以“未能有效防止亚历山卓的暗杀”为由，将卡特琳娜流放，AX被解散。
9、蔷薇十字骑士团策划的一系列活动，导致人类世界和帝国之间的关系戏剧性地恶化。利用所谓的致命“事件”，教皇厅出动了反阿尔比恩和帝国的十字军，这使得维持了百年的、长生种与短生种之间的平衡最终瓦解，短生种开始向长生种宣战。这时，卡特琳娜依旧沉浸在亚历山卓之死的悲伤之中，由于胶原病的恶化，她卧床不起，对这一局势无能为力。
10、由弗兰契斯柯领导的十字军开始入侵帝国，但被帝国军击败。同时，位于阿尔比恩的十字军在多佛海峡遭到艾丝缇军队的顽强抵抗后被迫撤退。接连的战败让弗兰契斯柯感到绝望，最终，他决定使用核武器……在核武器的攻击下，帝国第二大城市提米索拉（Timisoara）被毁灭。弗兰契斯柯的第二个目标是帝国首都拜占庭和阿尔比恩首都伦迪尼姆。
11、为了防止核攻击，塞丝不得不解开隐藏在帝国宫殿的方舟的重启封印，打算利用卫星轨道上的方舟所搭载的卫星炮来摧毁教皇厅的核军事基地。然而，这正是该隐所期待的。一旦塞丝揭开了封印，该隐就能进入系统，让狄特里希控制方舟，他们企图让方舟降落到地球上。
12、亚伯和以恩追踪着该隐的行踪进入拜占庭。在帝国，亚伯、塞丝和该隐展开了激战。战斗中，狄特里希启动了方舟上的卫星炮。罗马被直接命中，整个城市被摧毁。教皇厅全灭，弗兰契斯柯被杀。幸运的是，卡特琳娜正在米兰疗养，躲过了此劫。该隐依旧想让方舟降落到地球上，但塞丝牺牲了自己的生命阻止了他的计划。帝国女王芙乐蒂卡，即塞丝·奈特罗德死亡。混乱中，亚伯和该隐似乎同归于尽，但事实上两人都生还了，只是受了重伤。
13、罗马的毁灭和女王芙乐蒂卡被杀使世界陷入混乱中。两年后，由于蔷薇十字骑士团的操纵，亚伯·奈特罗德被陷害为“来自教皇厅的暗杀者”。因此，当人类世界由于失去了罗马和教皇厅而陷入混乱之时，帝国向短生种宣战。开战两年后，帝国夺取了短生种的一半领土。人类国家只有两个幸存下来，阿尔比恩和格马尼库斯。
14、作为战胜国，帝国由于无法控制领土的快速扩张而开始减慢行军速度。同时，艾丝缇的军队和她领导的前教皇厅成员（包括前AX成员）形成了一股顽强的反帝国力量，使帝国陷入两难境地。
15、年轻的Kaurstein伯爵之女卡米拉在街上捡到了一名短生种（亚伯），这个银发碧眼的短生种失去了记忆。经过调查，他似乎和阿尔比恩女王艾丝缇有着某种联系。急于想获得战功的卡米拉带着这个银发的年轻人进入了敌方领土，计划暗杀女王艾丝缇。但是，在和卡米拉一起行动时，亚伯的记忆开始逐渐恢复。最后，亚伯和艾丝缇再次相见。
16、加入蔷薇十字骑士团的卡特琳娜和托雷士登场了。卡特琳娜已经对自己的人生感到绝望，并迷失在对艾丝缇的嫉妒心之中……然而，这只是她利用的假象，她赌上了自己的人生，打算从内部摧毁骑士团。
17、显然，狄特里希从未信任过卡特琳娜和托雷士。不过，当该隐的完全恢复日益临近，他开始对该隐感到不自然（原文：awkward）。他被卡特琳娜提出的问题所困扰——在该隐完全复活后，骑士团、肯普法和你还有什么存在意义？——卡特琳娜对狄特里希展开心理攻势，并最终使他背叛了该隐。同时，女王艾丝缇、亚伯、卡特琳娜和以恩正准备开始与骑士团进行最后决战。
18、最后，最终舞台回到了卫星轨道上的方舟之上。打算将方舟扔向地球来毁灭世界的该隐，和为了阻止他的亚伯，开始了最终决战。